《2021全球益生菌产学研发展动向白皮书》显示，得益于人类微生物组研究的方法和理论的积累，益生菌研究领域仍在高速发展。基于目前对肠道菌群的认知，未来的益生菌干预会迈向个体化和精准干预。

在未来精准医疗研究的大背景下，个体化干预将是益生菌研究和临床应用的新趋势。但目前关于个性化益生菌的干预研究仍在起步阶段。

目前消费者对健康需求不同，消费人群也在细分化。由于肠道菌群会随年龄发生变化，且不同年龄段健康需求不同，因此，益生菌产品消费人群细分化趋势日益凸显。其中，中老年是值得密切关注的分支市场。

Lumina Intelligence发布的25个国家益生菌数据报告中显示，当前仅有13种益生菌产品是针对老年人的，市场上关于适用于老年人的免疫和便秘益生菌制剂存在巨大空白。

此外，近年来，益生菌产品除了改善胃肠道问题的传统功效外，也在积极拓展其他方向的益生功效。如益生菌行业出现了越来越多针对女性健康的新产品。

调查表明，瑞典市场上有25%的益生菌产品专门针对女性。Innova发布的数据显示，2015年到2017年，针对口腔健康的益生菌膳食补充剂的比例不断增加。