有害菌在肠内占优势时，会产生大量的有害物质，为了帮助排毒，肝脏的负担会大大增加。因为产生胰岛素的胰腺与肝脏有密切关系，肝脏的负担加重也会对胰岛素的分泌产生影响。

摄入葡萄糖后，必须先进入肠道，通过肠道上皮细胞吸收，然后才进入身体的其他部分。益生菌是葡萄糖的消耗大户，肠道内的益生菌喜欢利用葡萄糖，吞噬葡萄糖毫不费力。肠道益生菌群数量与多样性与人体糖耐量息息相关。

当肠道中有大量益生菌存在时，在肠道的上皮细胞上形成一个防护层，阻止大量的葡萄糖被肠道吸收，因此大大减少血液中的葡萄糖含量，血糖浓度就会降低。

此外益生菌能降低LPS（细菌脂多糖）浓度，减少炎症反应，提高胰岛素敏感性，改善胰岛素抵抗血糖，进而达到防治糖尿病的目的。

研究表明，菌群失调造成内毒素入血所致的慢性炎症，是肥胖、糖尿病等代谢性疾病发展的重要因素之一。菌群紊乱失衡可引发全身慢性反应炎症，从而导致胰岛β细胞损伤和胰岛素抵抗下降，同时影响体内其他细胞对糖分的吸收用以转化能量，造成人体机能难以正常运转，.后引发一系列并发症。