凝结芽孢杆菌具有超强的耐酸能力，可以有效直达肠道定植：当其进入肠道后会消耗游离氧而进行肠道繁殖，有利于厌氧微生物（乳酸菌和双歧杆菌）的生长，从而调节肠道内微生物菌群的平衡，提高机体的免疫力和抗病力，减少肠道疾病的发生。

凝结芽孢杆菌具有超强的适应性，凝结芽孢杆菌凝结芽孢杆菌是兼性厌氧菌，在有氧及无氧的环境下都可生长，能适应低氧的肠道环境，对酸和胆汁有较高的耐受性。而且芽孢杆菌无耐药性，稳定性极高。

凝结芽孢杆菌在肠道繁殖过程中会分泌淀粉酶和蛋白酶，促进机体对营养物质的消化和吸收。其产生的B族维生素、氨基酸和短链脂肪酸等物质能增加小肠蠕动速度，从而改善肠道的消化功能；另外凝结芽孢杆菌在肠道内定居后还能产生大量抑制有害菌的凝固素和L-乳酸等抑菌物质，对肠道炎症有治疗作用。

凝结芽孢杆菌能够形成芽孢，与其他不产乳酸的芽孢杆菌相比更有利于恢复胃肠道的微生态平衡。